De Athenaeumcollectie wordt op dit moment bewaard in een historisch pand aan het Klooster 12 in Deventer, dat wordt gedeeld met Collectie Overijssel. Dit pand en de depots voldoen niet langer aan de eisen voor duurzaam behoud, veiligheid en toegankelijkheid. Collectie Overijssel werkt daarom aan een nieuw, duurzaam Collectiecentrum in Deventer. In het voorkeursscenario verhuist de collectie van de  Athenaeumbibliotheek  mee naar dit nieuwe pand. In 2025 is de planvorming voor de verhuizing opgestart en onderzoek gedaan naar wat, hoe en hoeveel het gaat kosten.    

In 2025 vierde Nederland 80 jaar vrijheid. Ter voorbereiding op het herdenkingsjaar rondde metadataspecialist Carlijn Tetteroo de catalogisering van de Tweede Wereldoorlog-collectie af, die uit zo'n 480 objecten bestaat. Een selectie van de boeken, kranten, (lucht- )pamfletten en andere werken uit deze collectie was te bewonderen in de expositie 'Keuzevrijheid in de oorlog', die met de inzet van projectmedewerker Gerjan Brinksma tot stand kwam. Aansluitend gaf historicus en directeur van Deventer Verhaal Ewout van der Horst een multimediale presentatie, waarin hij stilstond bij de betekenis van vrijheid tijdens en na de Tweede Wereldoorlog

In het eerste kwartaal van 2025 toonde de expositie Op de tast boeken uit de Athenaeumcollectie die opvallen door bijzondere vormen of materialen. Centraal stond het volledig metalen boek getiteld 'Bodemgruis'. Ook werden er boekenrollen en leporello's getoond. Tijdens een speciale kinderactiviteit, PrutsHub x Athenaeumbibliotheek, maakten kinderen kennis met de historische leporello’s; boeken met een enkele, hele lange bladzijde, in harmonicavorm gevouwen. Daarna maakten zij een eigen exemplaar. Zo werd het Deventer boekenerfgoed tastbaar voor een jonge generatie.

De oeroude druk 'De spiritualibus ascensionibus' – in het Nederlands 'Over de geestelijke opklimmingen' – komt terug naar Deventer. Deze wiegendruk oftewel incunabel, uitgegeven rond 1483 door de in Deventer gevestigde drukker Richard Pafraet, werd na spannende onderhandelingen in de Verenigde Staten aangekocht door de Vereniging van Vrienden van de Athenaeumbibliotheek. Het werk, waarin Gerard Zerbolt (1367-1398) beschrijft hoe een zondige gelovige door boetedoening weer dichtbij God kan komen, wordt in bruikleen gegeven aan de Athenaeumbibliotheek. De Stentor wijdde een artikel aan deze bijzondere aanwinst, met interviews met Suzan Folkerts, conservator van de Athenaeumbibliotheek en Eva Kleeman, directeur van de Ter Borch Stichting.

Op vrijdag 21 november 2025 organiseerde de Athenaeumbibliotheek een symposium rond een bijzondere aanwinst: een vijftiende-eeuws getijdenboek uit de IJsselstreek. Het bevat gebeden die dagelijks in de kloosters werden gelezen en door Geert Grote werden vertaald in de volkstaal, voor ‘gewone’ gelovigen. Tijdens het symposium namen diverse sprekers het publiek mee in allerlei aspecten van het handschrift: de herkomst, de inhoud en de verluchting (decoratie). Het boek is als bruikleen van het Rijk in de Athenaeumcollectie opgenomen. Ook werd het gedigitaliseerd door het KB-project Metamorfoze, waarmee het voor iedereen online toegankelijk gemaakt is.